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上海固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

关键词: 上海固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究 PNGaseF去糖基化酶

2024.07.10

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Genvis测试去除唾液酸以揭示电荷变体:唾液酸是带负电荷的糖残基,存在于 N- 和 O-连接的聚糖上。唾液酸的固有电荷可能会使分析工作流程复杂化,从而掩盖其他重要的修饰。Microspin 色谱柱可用于 2 x 0.5 mg、5 x 0.5 mg 或 10 x 0.5 mg 糖蛋白的去唾液酸化。1. 易于使用的离心柱;2. 提高酶与底物的比例,提高消化效率;3. 样品中不含酶。因此,唾液酸的去除有助于研究蛋白质中的潜在变体。该应用展示了一种快速简便的样品制备方法,可在电荷异构体分析之前去除所有唾液酸。现O-糖基化药有Tn抗原,定量he心 GalNAc 水平,减少了异质性。上海固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

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水解O-聚糖的酶不会从变性中获益,这就是为什么OmniGLYZOR色谱柱只能在天然条件下使用的原因。 OmniGLYZOR 试剂盒 Microspin 以含有足够材料的试剂盒形式提供,可使5 × 50-100 μg 或 10 × 50-100 μg 糖蛋白去糖酸化。N-和O-连接聚糖的快速高效;与LC-MS兼容;完全去除聚糖,改进基础蛋白的分析;固定形式可提高酶与底物的比率,从而实现快速去糖基化。 IgdE酶(FabALACTICA®)和PNGaseF酶分别购自Genovis(马萨诸塞州,美国)。用于水解糖蛋白上N-聚糖的冻干酶。Genovis的PNGase F 冻干剂以冻干粉的形式提供,装在 1000 或 5 x 1000 单位小瓶中,分别用于消化 1 mg 或 5 x 1 mg 糖蛋白。高活性/无非特异酶活PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究ImpaRATOR 来源于铜绿假单胞菌,在大肠杆菌中表达。该酶含有 His 标签,分子量为 97 kDa。

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α连接的Genovis的GalNAcs的水解:GalNAcEXO 是一种 α-N-乙酰半乳糖胺苷酶,可有效水解糖蛋白上的末端 GalNAc 残基。与丝氨酸或苏氨酸连接的 GalNAc(称为 Tn 抗原)被 GalNAcEXO 快速有效地水解,并且该酶还在 α1-3 连接的末端 GalNAcs 上显示出活性。Genovis的GalNAcEXO 是一种外α-N-乙酰半乳糖胺酶,用于有效水解与糖蛋白(Tn 抗原)中的丝氨酸或苏氨酸残基相连的 α-N-乙酰半乳糖胺 (GalNAc)。该酶还在 α1-3 连接的末端 GalNAc 上显示活性。GalNAcEXO 在天然条件下水解糖蛋白上的 GalNAc,在 pH 值 6.0 至 7.6 范围内具有高度活性。

Genovis的ImpaRATOR™ 和 OpeRATOR® - 两种协同的作用:O-糖蛋白酶。使用ImpaRATOR或OpeRATOR消化后分析依那西普重糖基化区域O-聚糖位点的覆盖率(图3)。使用OpeRATOR鉴定对应于所有13个O-聚糖位点的肽,而使用ImpaRATOR只能明确鉴定10个位点。ImpaRATOR 可能比 OpeRATOR (1) 具有更具选择性的氨基酸序列偏好,此处由 S186 和 T245 位点缺乏消化来表明。此外,ImpaRATOR 在两个相邻的 O-糖基化氨基酸之间显示出有限的裂解,如 S213 位点酶解肽的缺乏以及 T200 和 T217 位点酶解肽的低强度所证明的那样。在OpeRATOR酶解样品(T184-S199和T200-H204;图2b和d),而在ImpaRATOR消化的样品中,具有漏裂的相应肽(S184-H204)的强度更高。 虽然OpeRATOR显示出更高的O-聚糖位点覆盖率,但使用ImpaRATOR进行消化可以表征O-聚糖结构,包括唾液酸化物种。例如,条形图插入显示了两种糖肽 T184-V198 和 T205-P207 的 O-聚糖种类。这应该与使用OpeRATOR的消化进行比较,在OpeRATOR中,必须去除唾液酸才能产生酶活性,这意味着有关唾液酸化的信息丢失。总而言之,ImpaRATOR 和 OpeRATOR 酶共同提供了有关聚糖组成和 O-聚糖位点的完整信息。在天然条件下使用OmniGLYZOR Microspin色谱柱,可在3小时内有效去除C1 抑制剂O-聚糖。

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Genovis的FucosEXO 是 α-岩藻糖苷酶的混合物,用于有效水解天然 N-和 O-糖基化蛋白或游离寡糖上的 α1-2、α1-3 和 α1-4-连接岩藻糖残基。它是 N-和 O-糖蛋白的聚糖结构分析以及寡糖的外切糖苷酶阵列的宝贵工具。1. 高效α-岩藻糖苷酶混合物 – 快速去除 α1-2、α1-3 和 α1-4-连接的岩藻糖;2. 可靠的酶解增加了对外切糖苷酶阵列的信心;3. 可固定在即用型离心柱中。用于糖蛋白去氟糖基化的冻干酶。Genovis的FucosEXO冻干剂以冻干粉的形式提供,装在2000单位的小瓶中,用于2mg糖蛋白的去碳基化。OglyZOR 是一种内切糖苷酶用于确认O-糖的存在和降低样品的异质性。湖北PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

对天然糖蛋白或游离的聚糖结构上存在的 N- 和 O-连接聚糖均具有活性。上海固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

GlycOCATCH用于纯化粘蛋白型O-糖基化蛋白和肽。它是基于无活性的Genovis的OpeRATOR®酶,该酶经过工程改造,可以高亲和力结合O-糖基化蛋白和肽。GlycOCATCH的应用包括O糖蛋白和肽的特异性富集或去除、糖组学、复杂样品的研究和生物制药的表征。1. 粘蛋白型O-糖基化蛋白和肽的特异性富集;2. 可靠 - 高亲和力结合;3. 快速且易于使用的工作流程。不需要辅助因子或特殊缓冲液。GalNAcEXO中的酶来源于Akkermansia muciniphila,在大肠杆菌中表达,带有His标签,分子量为52 kDa。1. 用于方法开发的灵活格式;2. 可以结合酶以提高效率;3. 适用于自动化工作流程; 4. 即用型 - 只需加水即可!用于水解糖蛋白上GalNAc残基的冻干酶。Genovis的GalNAcEXO冻干剂以冻干粉末的形式提供,装在2000单位的小瓶中,用于水解2mg糖蛋白上的GalNAc残基。上海固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

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