河南免疫共沉淀检测CoIP-MS

IP-Mass（免疫沉淀-质谱）技术是一种结合了免疫沉淀和质谱分析的方法，用于研究蛋白质相互作用和差异蛋白质分析。该技术首先利用特异性抗体与目标蛋白结合，形成抗原-抗体复合物。然后，这些复合物被吸附到固相载体上，经过洗涤步骤去除非特异性结合的杂质。接下来，蛋白质复合物从载体上洗脱下来，并通过质谱分析进行鉴定和检测。质谱分析是IP-Mass技术的重要部分，它可以提供关于蛋白质的质量、荷质比和丰度等信息。通过对质谱数据的分析，可以鉴定出与目标蛋白相互作用的蛋白质，以及蛋白质之间的相互作用强度和特异性。然而，IP-Mass技术也存在一些局限性，如抗体特异性、样品制备和实验条件等因素可能对结果产生影响。因此，在使用该技术时，需要注意控制实验条件，选择特异性强的抗体，并结合其他实验方法进行验证和确认。Co-IP内源检测验证蛋白互作，结果可靠需严控条件，抗体特异、洗涤充分是关键！河南免疫共沉淀检测CoIP-MS

CoIP-Mass和CoIP-WB优劣势：优势：高通量获得目的蛋白的专属蛋白互作库。劣势：CoIP的蛋白库鱼龙混杂，包含目的蛋白的直接/间接互作蛋白，非特异结合，残留蛋白。常规理想IP-Mass项目可鉴定到1000-2000个蛋白，其中绝大部分是非特异性结合及清洗残留的背景蛋白，导致CoIP-Mass假阳性高，CoIP-WB验证成功率低，导致研发进展反复跌宕，时间和经费成本占用较大，严重影响士气。其次，项目受限于蛋白表达量和IP抗体有效性，达到理想状态的CoIP-Mass较难，同时分析门槛较高。因此，该项目成功实施，比较依赖成熟和有分析经验的团队。建议整包交给专业的服务商开展检测。广东免疫共沉淀CoIP WBCo-IP和ChIP实验对象有什么区别。

在CoIP（免疫共沉淀）实验中，对照组的设置对于验证实验结果的准确性和可靠性至关重要。对照组的主要目的是排除非特异性结合和背景干扰，从而更准确地评估目标蛋白与诱饵蛋白之间的相互作用。阴性对照组设计建议：1. 无抗体对照组：在免疫沉淀步骤中不加入特异性抗体，以检测是否存在非特异性结合。如果在此条件下仍然检测到目标蛋白，则可能是非特异性结合，需要在分析时予以排除。2. 无关抗体对照组：使用与诱饵蛋白和靶蛋白均无关的抗体进行免疫沉淀，以验证特异性抗体的作用。如果在此条件下未检测到目标蛋白，则可以增强对特异性抗体所检测到的相互作用的信心。

CoIP实验免疫沉淀方法如下：

将25µL(0.25mg)的Pierce蛋白A/G的磁珠加入1.5mL离心管中。

向磁珠中加入175µL免疫沉淀裂解/漂洗缓冲液，轻微涡旋混匀。

将离心管放入磁力架中收集磁珠到离心管的一边。去除上清。

向离心管中加入1mL免疫沉淀裂解/漂洗缓冲液。颠倒离心管数次或轻微涡旋混匀1min。用磁力架收集磁珠。去除上清。

将抗原样品/抗体混合物加入盛有磁珠的离心管中，保持混匀室温下孵育1h。

用磁力架收集磁珠，除去未结合的样品，保存以备分析。

向离心管中加入500µL免疫沉淀裂解/漂洗缓冲液，轻柔混匀。收集磁珠，弃上清。再重复洗两次。

向管中加入500µL超纯水，轻柔混匀。用磁力架收集磁珠，弃上清。

低pH洗脱：向离心管中加入100µL洗脱液。保持混匀在室温下孵育离心管10min。通过磁力分离磁珠，保留含有目的抗原的上清。每100µL洗出液中加入10µL中和液来中和低pH。备选洗脱方法：向离心管中加入100µL1X电泳上样缓冲液，将样品置于加热器中，96-100℃加热10min。通过磁力架分离磁珠，保留含有目的抗原的上清。

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Co-IP实验原理主要基于抗原-抗体特异性结合以及蛋白质-蛋白质相互作用。具体来说，当细胞在非变性条件下被裂解时，细胞内存在的许多蛋白质-蛋白质间的相互作用会被保留下来。实验中，利用靶蛋白的特异性抗体与靶蛋白结合形成复合物，然后通过免疫反应将复合物与固定在固相支持物（如琼脂糖珠或磁珠）上的亲和剂（如Protein A/G）结合。经过一系列的洗涤步骤后，可以去除非特异性结合的蛋白质，将目标蛋白质及其相互作用的蛋白质富集在固相支持物上。通过电泳、质谱分析等技术对富集的蛋白质进行分析，从而鉴定和定量相互作用的蛋白质。IP-Mass（免疫沉淀-质谱）技术应用场景。天津相互作用蛋白检测CoIP Western Blot检测

免疫共沉淀法证实蛋白互作，基于抗体专一性，揭示生理性相互作用。河南免疫共沉淀检测CoIP-MS

在CoIP（免疫共沉淀）实验中，对照组的设计对实验结果尤为重要，阳性对照组设计建议如下：1. 已知相互作用蛋白对照组：如果可能的话，使用已知与诱饵蛋白相互作用的蛋白作为阳性对照。这可以验证实验条件的可行性，以及抗体和实验方法的可靠性。2. 设置过量诱饵蛋白对照组：通过加入过量的诱饵蛋白，可以验证靶蛋白与诱饵蛋白之间的相互作用是否具有饱和性。如果加入过量诱饵蛋白后，靶蛋白的结合减少或消失，则表明相互作用具有饱和性。河南免疫共沉淀检测CoIP-MS