吉林GingisKHANIdeS蛋白酶蛋白组学
关键词: 吉林GingisKHANIdeS蛋白酶蛋白组学 IdeS蛋白酶
2024.11.19
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为什么客户想在他们的工作试用Genovis的FabRICATOR(IdeS)。FabRICATOR的高特异性(在铰链下方有单个消化位点)以及它对IgG种和亚类表现出活性的事实使其成为高效表征一系列不同分子的理想工具。FabRICATOR的另一大优势是速度。在大多数IgG上,您可以在短短30分钟内生成F(ab’)2和Fc/2片段,这一速度简化了方法开发,并允许快速有效的中层表征,使客户能够在不比做完整质量实验长太多的时间内获得更多关于分子的信息。Genovis发现更多的缓冲液与溶液中的FabRICATOR消解相容(更多信息)。Genovis已经测试了PBS和150mM醋酸铵,pH7,结果良好。并且应该也适用于FabRICATORHPLC。然而,缓冲液的离子强度会影响抗体片段在FabRICATORHPLC(IdeS)色谱柱上的保留,并且IgG1亚基需要至少100-150mM盐才能洗脱为单个窄峰。其他IgG亚类或融合蛋白可能需要对缓冲液组成进行一些优化。自动抗体亚基分析可减少操作人员的时间和样品处理错误的风险,并提高通量。吉林GingisKHANIdeS蛋白酶蛋白组学
与IdeS不同,Genovis的GingisKHAN(Kgp)是一种半胱氨酸蛋白酶,可在铰链上方的单个位点(KSCDK/THTCPPC)消化人IgG1,产生完整且均质的Fab和Fc片段。GingisKHAN是一种赖氨酸特异性蛋白酶。单一的消化位点是人IgG1三维结构的结果,使这种赖氨酸暴露于酶中。如果去除N-聚糖,则Fc上暴露的赖氨酸处可能会出现额外的消化位点。GingisKHAN需要温和的还原条件才能具有活性,并且在37°C和pH8下获得活性。还原剂(2mM半胱氨酸)与酶一起提供。GingisKHAN是从牙龈卟啉单胞菌中纯化的。该酶用于使用LC-MS表征基于抗体的生物zhiliao药物,研究Fc聚糖分析、双特异性抗体、亲和力和亲和力效应,并鉴定翻译后修饰。吉林GingisKHANIdeS蛋白酶蛋白组学该酶对具有突变铰链区域的抗体(如 LALA 突变)具有活性。
与IdeS不同。Genovis的IgASAPSub1是一种IgA1特异性酶,可在铰链上方的一个特定位点消化人IgA1,产生完整且均质的Fab和Fc片段。IgASAPSub1可水解分泌物和血清IgA1。消化在1小时内完成,并且由于酶的特异性,如果孵育时间延长,则不存在过度消化的风险。该酶在pH值6.5至8.0下具有活性,不需要还原条件或辅助因子即可发挥活性。活性是在37°C下,但也可以在室温下使用增加孵育时间进行消化。IgASAPSub1是从口腔链球菌克隆而来的,并在大肠杆菌中表达。该酶含有His标签,分子量为148kDa。IgASAPSub1冻干剂以冻干粉的形式提供,装在1000个单位的小瓶中,用于消化1mgIgA1。
蛋白酶用于生成肽,用于质谱分析蛋白质。这些应用包括蛋白质组学和生物制药的深度表征。由于遗漏了切割和样品制备诱导的伪影,传统的蛋白酶并不总是理想的,因此需要具有不同特异性的蛋白酶工具箱。Genovis的GingisREX 是一种精氨酸特异性蛋白酶,可将蛋白质 C 末端消化为精氨酸残基。与胰蛋白酶肽相比,所得肽更长,并可能导致序列覆盖率增加。质谱分析中蛋白酶的特异性对于获得高质量的数据集和避免复杂的数据解释至关重要。作为模型底物,使用胰岛素氧化β链来比较 GingisREX 和 ArgC 的酶特异性。胰岛素氧化β链含有一个精氨酸和一个赖氨酸残基。在RP-HPLC和质谱法上分析GingisREX和ArgC的酶切肽。GingisREX在赖氨酸残基上没有酶活性或其他额外活性,即使在长时间孵育过夜后,酶与底物的比例也很高(1:5)。然而,ArgC在精氨酸残基上显示出主要活性,但在赖氨酸残基上也可以看到酶消化。在酶与底物的比例为 1:20 和过夜孵育下,证明了 ArgC 的额外非特异性活性。在相同条件下,GingisREX未检测到这种情况。数据证实了GingisREX精氨酸残基的特异性活性,并显示使用Arg-C在赖氨酸和其他残基处的非特异性消化。在铰链正上方的一个特定位点消化人 IgG1,产生完整的 Fab 和 Fc 片段。
用于IgA1和IgA2m1以上铰链消化的冻干酶。与IdeS不同,Genovis提供的IgASAPSub1+2在铰链上方的一个特定位点消化人IgA1和IgA2m1,产生完整且均匀的Fab和Fc片段。由于人IgA1的铰链比IgA2的铰链长,因此IgA1和IgA2m1之间来自消化位点的氨基酸C末端不同。IgASAPSub1+2可消化分泌物和血清IgA。孵育时间为过夜(16-18小时),并且由于酶的特异性,没有过度消化的风险。该酶在pH值为6.0至8.0时具有活性,不需要还原条件或辅助因子即可产生活性。活性为37°C。IgASAPSub1+2是从丹毒梭菌克隆而来的,并在大肠杆菌中表达。该酶含有His标签,分子量为131kDa。IgASAPSub1+2冻干剂以冻干粉的形式提供,装在1000个单位的小瓶中,用于消化1mgIgA1和IgA2m1。半胱氨酸蛋白酶,可在来自多个不同物种和亚类的 IgG 的铰链区域消化,产生 Fab 和 Fc 片段。FabALACTICAIdeS蛋白酶
使用FabRICATOR(IdeS)的抗体消化的简单性、速度和可重复性也意味着这种酶可以被用于质量控制应用。吉林GingisKHANIdeS蛋白酶蛋白组学
IgA 消化酶的 IgASAP 家族特异性消化血清和分泌型人 IgA 以生成 Fab 和 Fc 片段。IgASAP Sub1 特异性消化人 IgA1,而 IgASAP Sub1+2 同时消化人 IgA1 和 IgA2m1。 Sub1+2 特异性消化铰链上方的 IgA1 和 IgA2m1。两种酶都产生完整且均质的 Fab 和 Fc 片段。为了获得纯和完整的Fab片段,使用Genovis的GingisKHAN Fab Kit进行人IgG1的消化和抗体片段的后续纯化。通过与 GingisKHAN 孵育,然后在 CaptureSelect™ 人 CH1 离心柱上亲和纯化,在曲妥珠单抗上证明了完整的片段生成。样品的酶和Fc部分存在于色谱柱的流通中,Fab很容易通过降低pH洗脱。使用该试剂盒,可以制备 0.5 mg 至 2 mg 人 IgG1 的 Fab 片段。Genovis同时提供IdeS酶的纯化试剂盒。 吉林GingisKHANIdeS蛋白酶蛋白组学
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