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温州Co IP免疫沉淀实验视频

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2024.06.30

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ChIP（染色质免疫沉淀）实验是一种用于研究蛋白质与DNA相互作用的技术。以下是ChIP实验的实验方法概述：

1. 交联：将细胞与交联剂（如1%甲醛）孵育，通常在室温下进行10-15分钟。

2. 终止交联：添加甘氨酸以终止交联反应，孵育5分钟。

3. 收集细胞：通过离心收集细胞，并用PBS洗涤以去除交联剂。

4. 细胞裂解：使用裂解缓冲液裂解细胞，释放染色质。

5. 染色质剪切：使用超声波或酶消化将染色质剪切成适当大小的片段。

6. 免疫沉淀：将剪切后的染色质与特异性抗体孵育，然后添加蛋白A/G磁珠。

7. 洗涤：用低盐、高盐和LiCl洗涤液洗涤磁珠，去除非特异性结合物。

8. 洗脱：用洗脱缓冲液洗脱DNA。

9. 逆转交联：用蛋白酶K处理，然后在65°C下加热过夜以逆转交联。

10. DNA纯化：使用商业试剂盒或标准酚/氯仿方法纯化DNA。

11. 分析：使用qPCR分析富集的DNA，或进行测序以确定蛋白质结合位点。

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免疫沉淀实验步骤：

1. 样品制备

a. 悬浮细胞样品处理：离心收集细胞（4℃, 1000g, 5 min），用手指把细胞用力弹散。按照6孔板每孔细胞加入150-250 μL裂解液的比例加入含蛋白酶抑制剂的裂解液（裂解液应在使用前数分钟内加入蛋白酶抑制剂Cocktail，使蛋白酶抑制剂Cocktail的终浓度为1×）。混匀后置于冰上处理10 min；离心收集上清液（4℃, 14000g, 10 min），置于冰上备用（或置于-20℃长期保存）。

b. 贴壁细胞样品处理：移去培养基，用PBS清洗细胞两遍；用细胞刮棒刮脱细胞，收集至1.5mL EP管内，按照6孔板每孔加入150-250 μL裂解液的比例加入含蛋白酶抑制剂的裂解液（裂解液应在使用前数分钟内加入蛋白酶抑制剂Cocktail，使蛋白酶抑制剂Cocktail的终浓度为1×）。吹打数下，使裂解液和细胞充分接触。混匀后置于冰上处理10 min；离心收集上清液（4℃, 14000g, 10 min），置于冰上备用（或置于-20℃长期保存）。

4. 后续：磁珠预处理——抗体吸附——抗原结合反应——抗体洗脱

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免疫沉淀技术（Immunoprecipitation，简称IP）是一种生物化学方法，它利用特异性抗体对抗原进行亲和纯化。在含有目的抗原的细胞裂解液中加入特定的抗体以及Protein A/G-Beads（预先将Protein A/G固定结合在磁珠上），根据抗原与抗体、Protein A/G与抗体的Fc的特异性，形成“抗原-抗体-Protein A/G-Beads”复合物，清洗离心后去除溶液中未结合的杂蛋白，检测是否存在目的蛋白。

免疫沉淀技术常用于从细胞或组织裂解物中分离用于免疫印迹检测或其他检测技术的蛋白和其他生物分子。它的目标是分离足够用于Western Blot或其他检测方法检测的蛋白质。

免疫沉淀技术（Immunoprecipitation, IP）是一种用于研究蛋白质相互作用和纯化特定蛋白质的实验方法。

优点:

1. 特异性强：利用特异性抗体捕获目标蛋白，可以有效地从复杂的生物样本中分离出感兴趣的蛋白质。

2. 灵敏度高：可以检测到低丰度的蛋白质，包括瞬态或弱相互作用的蛋白质复合物。

3. 应用范围广：适用于多种生物样本，如细胞裂解物、组织提取物和生物流体。

4. 生物学洞察深入：能够揭示蛋白质之间的相互作用网络，有助于理解细胞内的信号传递和调控机制。

5. 可与其他技术联用：如与质谱（IP-MS）联用，可以准确鉴定蛋白质及其相互作用伙伴。

缺点:

1. 对抗体依赖性高：需要高亲和力和高特异性的抗体，抗体的质量直接影响实验结果。

2. 可能存在非特异性结合：样本中的其他蛋白质可能与抗体或固相支持物发生非特异性结合，导致背景噪音。

3. 可能影响蛋白质的天然状态：裂解和沉淀过程可能会改变蛋白质的构象和功能。