云南PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

Genvois的SialEXO产品是唾液酸酶，用于N-和O-糖基化蛋白的有效去唾液酸化。SialEXO冻干由两种唾液酸酶组成，每种唾液酸酶都具有独特的活性，并且它们同时起作用。一种酶对α2-3、α2-6和α2-8连接的唾液酸具有很好的活性，另一种酶（SialEXO 2-3）通过α2-3-键快速水解唾液酸。SialEXO冻干可在2小时内去除天然蛋白质上的所有唾液酸。SialEXO在天然条件下水解糖蛋白，在pH值范围为6.5至9时显示出活性。这些酶来源于Akkermansia muciniphila，并在大肠杆菌中表达。两种酶都含有 His 标签，酶的分子量为 43 kDa 和 66 kDa。 融合蛋白和其他糖基化蛋白上的 N 和简单的粘蛋白型 O-聚糖。云南PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

GalactEXO中的酶来源于Akkermansia muciniphila，并在大肠杆菌中表达。GalactEXO由两种半乳糖苷酶组成，均带有His标签，组分的分子量为87 kDa和109 kDa。用于水解糖蛋白上β1-3,4-连接半乳糖的冻干酶。Genovis的GalactEXO 冻干剂以冻干粉的形式提供，装在 2000 单位小瓶中，用于在 2 mg 糖蛋白上水解 β1-3,4-连接的半乳糖。1. 用于方法开发的灵活格式；2. 可以结合酶以提高效率； 3. 适用于自动化工作流程；4. 即用型 - 只需加水即可！将混合物加载到GlycOCATCH上，洗涤树脂，并用8M尿素洗脱结合的肽。纯化后，在RP-LC-MS上分离样品。数据显示，糖苷酸肽的选择性纯化，携带he心1-O-聚糖。IgA 特异性 O-糖肽富集：IgA 抗体包含 N-连接的糖基化和重度 O-糖基化的铰链区域。胰蛋白酶消化IgA后，将肽和genovis 的SialEXO的混合物加载到GlycOCATCH树脂上，并用PBS和离心洗涤。用 8 M 尿素洗脱显示预期的 O-糖基化铰链肽富集，具有不同程度的糖基化。陕西固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究OglyZOR 酶可有效水解天然糖蛋白中的he心 1 二糖 （Gal-β1,3-GalNAc）；

使用Genovis的OpeRATOR图谱O-聚糖位点对依那西普进行LC-MS分析：依那西普是一种 Fc 融合蛋白，具有高度 O-糖基化的铰链区域。将依那西普与OpeRAT一起孵育，并使用LC-MS/MS分析所得糖肽。促红xibao生成素 （EPO） 是一种具有单个 O-糖基化位点的 ~30 kDa 糖蛋白。在PNGase F去除N-糖并使用SialEXO进行去唾液酸化后，用OpeRAT消化天然蛋白，并通过反相LC-MS分析所得蛋白质片段。O-糖基化的位点可以通过识别OeRATOR消化位点直接推断出来。为了获得良好性能，需要去除唾液酸助剂，因此购买中包括2000个单位（如果SialEXO冻干）。1. 用于方法开发的灵活产品形式；2. 可以结合酶以提高效率；3. 适用于自动化工作流程；4. 即用型 - 只需加水即可。O-聚糖是OpeRATOR活性所必需的，而该酶在N-聚糖上没有活性。OpeRATOR和SialEXO处理后，O-糖基化蛋白被消化成携带O-聚糖的肽。消化发生在O-糖基化位点的N端。

genvois的OpeRATOR 是一种内切蛋白酶，可催化直接靠近 O-聚糖的天然粘蛋白型 O-糖基化蛋白的肽键的水解。内切蛋白酶具有高特异性，可消化丝氨酸或苏氨酸残基的O-聚糖N端的蛋白质。 OpeRATOR 活性需要粘蛋白型的 O-聚糖，并且该酶不会用 N-连接聚糖消化糖蛋白。该酶对具有亚洲化he心1 O-聚糖的位点z活跃。它还消化唾液酸化的he心 1 和he心 3，但程度要低得多。为了获得z佳性能，需要去除唾液酸，因此，SialEXO冻干（唾液酸酶混合物）包含在购买中。 O-和N-糖基化蛋白的高效α2-3去唾液酸化可以在1小时内实现。

GalNAcEXO固定化离心柱含有与琼脂糖珠共价偶联的GalNAcEXO酶，用于水解糖蛋白上的GalNAc残基，而不会用酶污染制剂。Microspin 色谱柱可用于水解 5 或 10 x 0.5 mg 糖蛋白。1. 易于使用的离心柱；2. 提高酶与底物的比例，提高消化效率；3. 终样品中不含酶。用于水解离心柱中糖蛋白上的Genovis的GalNAc残基的固定化酶。GalNAcEXO 酶是一种n 外α-N-乙酰半乳糖氨酸酶，可快速有效地水解来自天然 O-糖蛋白的 z es GalNAc 残基。 该酶来源于Akkermansia muciniphila，在大肠杆菌中表达，带有His标签，分子量为52 kDa。 该酶在 Tn 抗原和 α1-3 连接末端 GalNAcs 上均显示活性。在这里，我们展示了如何使用GalNAcEXO来表征复杂的生物制药。使用OpeRATOR对胞生成素（EPO）进行O-糖位点特异性消化：确定中级水平的 O-糖基化位点。云南PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

PNGase F 以冻干粉的形式提供，装在 1000 或 5 x 1000 单位小瓶中，分别用于消化 1 mg 或 5 x 1 mg 糖蛋白。云南PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

对Genovis的ImpaRATOR处理的样品的分析表明，ImpaRATOR很好地消化了所有三种底物并产生了相似的糖肽，但预期的聚糖种类不同。用ImpaRATOR处理的样品比其他样品含有更多的变异，因为每种肽都检测到多种聚糖结构。观察到的聚糖种类主要是单唾液酸化和二唾液酸化he心1结构，这与依那西普的预期一致。用ImpaRATOR或OpeRATOR消化的SialEXO预处理样品均产生具有裸核1结构的肽，但携带在ImpaRATOR消化样品中观察到的Tn抗原的肽T205-P207除外。依那西普用 SialEXO 和 GalactEXO 预处理，然后用 ImpaRATOR 消化，得到含有 Tn 抗原的肽。总之，这些数据证明了ImpaRATOR的高聚糖底物接受度。ImpaRATOR处理的依那西普显示出与相应的去唾液酸化OpeRATOR处理样品略有不同的消化模式。例如，OpeRATOR在两个O-糖基化氨基酸之间消化的效率比ImpaRATOR更有效。具有完整唾液酸或Tn抗原的依那西普被OpeRATOR消化得非常弱（数据未显示）。云南PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究