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山东瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

关键词: 山东瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶糖生物学研究 PNGaseF去糖基化酶

2024.07.04

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Genovis的PNGase F 是一种糖酰胺酶,可水解多肽天冬酰胺与所有哺乳动物天冬酰胺连接复合物、杂交体或高甘露糖寡糖的内层 GlcNAc 之间的酰胺键。 在反应过程中,从中去除聚糖的天冬酰胺残基被脱酰胺为天冬氨酸。释放的低聚糖完好无损,可用于进一步分析。N-糖的去除被用于MS分析的样品制备,以降低蛋白质的异质性,使游离的糖分析成为可能,并研究N-糖的功能作用。 该酶在大肠杆菌中表达,该重组基因来源于伊丽莎白金氏脑膜败血症。 评价抗体片段对完整蛋白聚集的影响。 IgG1 mAb1和mAb2在Biogen生产。 mAb1被糖基化,主要的糖型是具有0和1半乳糖的he心聚焦双触角聚糖(FA2和FA2G1); mAb2被糖基化。GalactEXO中的酶来源于Akkermansia muciniphila,并在大肠杆菌中表达。山东瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

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genvois的OpeRATOR 是一种内切蛋白酶,可催化直接靠近 O-聚糖的天然粘蛋白型 O-糖基化蛋白的肽键的水解。内切蛋白酶具有高特异性,可消化丝氨酸或苏氨酸残基的O-聚糖N端的蛋白质。 OpeRATOR 活性需要粘蛋白型的 O-聚糖,并且该酶不会用 N-连接聚糖消化糖蛋白。该酶对具有亚洲化he心1 O-聚糖的位点z活跃。它还消化唾液酸化的he心 1 和he心 3,但程度要低得多。为了获得z佳性能,需要去除唾液酸,因此,SialEXO冻干(唾液酸酶混合物)包含在购买中。 辽宁瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶疾病机理研究ImpaRATOR 冻干剂以冻干粉末的形式提供,装在 2000 单位小瓶中,用于消化 2 mg O-糖基化蛋白。

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使用Genovis的OpeRATOR图谱O-聚糖位点对依那西普进行LC-MS分析:依那西普是一种 Fc 融合蛋白,具有高度 O-糖基化的铰链区域。将依那西普与OpeRAT一起孵育,并使用LC-MS/MS分析所得糖肽。促红xibao生成素 (EPO) 是一种具有单个 O-糖基化位点的 ~30 kDa 糖蛋白。在PNGase F去除N-糖并使用SialEXO进行去唾液酸化后,用OpeRAT消化天然蛋白,并通过反相LC-MS分析所得蛋白质片段。O-糖基化的位点可以通过识别OeRATOR消化位点直接推断出来。为了获得良好性能,需要去除唾液酸助剂,因此购买中包括2000个单位(如果SialEXO冻干)。1. 用于方法开发的灵活产品形式;2. 可以结合酶以提高效率;3. 适用于自动化工作流程;4. 即用型 - 只需加水即可。O-聚糖是OpeRATOR活性所必需的,而该酶在N-聚糖上没有活性。OpeRATOR和SialEXO处理后,O-糖基化蛋白被消化成携带O-聚糖的肽。消化发生在O-糖基化位点的N端。

Genovis的FucosEXO 是 α-岩藻糖苷酶的混合物,用于有效水解天然 N-和 O-糖基化蛋白或游离寡糖上的 α1-2、α1-3 和 α1-4-连接岩藻糖残基。它是 N-和 O-糖蛋白的聚糖结构分析以及寡糖的外切糖苷酶阵列的宝贵工具。1. 高效α-岩藻糖苷酶混合物 – 快速去除 α1-2、α1-3 和 α1-4-连接的岩藻糖;2. 可靠的酶解增加了对外切糖苷酶阵列的信心;3. 可固定在即用型离心柱中。用于糖蛋白去氟糖基化的冻干酶。Genovis的FucosEXO冻干剂以冻干粉的形式提供,装在2000单位的小瓶中,用于2mg糖蛋白的去碳基化。O-糖基化蛋白和肽的特异性富集:包括抑制病原体引起的gan染、炎症反应、造血和细胞信号传导。

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为了证明Genovis的PNGase F冻干和PNGase F固定在各种底物上的去糖基化能力,用PNGase F冻干或PNGase F固定化处理了一系列糖蛋白。使用天然反应条件在一小时内有效去除曲妥珠单抗和依那西普上的所有N-糖,以及西妥昔单抗上的Fc-糖。当加入RapiGest™并在变性条件下进行反应时,西妥昔单抗的所有N-聚糖(包括Fab-聚糖)在PNGase F固定化10分钟内完全去除,PNGase F固定化15分钟内完全去除。在变性反应条件下,PNGase F 在 30 分钟内成功将更复杂的 F 融合蛋白阿巴西普和阿柏西普去糖基化。使用变性和还原反应条件,将常用的糖蛋白标准品RNase B在10或15分钟内完全去糖基化,分别使用PNGase F冻干或PNGase F固定化。在天然和变性条件下生成的去糖基化样品与LC-MS分析兼容。依那西普和曲妥珠单抗游离聚糖。云南冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶瑞典Genovis

将依那西普与GalactEXO固定化孵育60分钟。山东瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

当在完整状态下进行分析时,EPO的聚糖异质性导致了非常复杂的质谱图。通过在 37°C 下在 OmniGLYZOR Microspin 柱上孵育 1 小时,可以有效地去除 N 糖(含有PNGase F酶)和 O-糖,如对应于未修饰蛋白质的单个峰所示。EPO上残留了少量用乙酰化唾液酸修饰的O-聚糖,因为OmniGLYZOR对这种结构的水解效率低下。根据制造商Genvois的建议(在37°C下进行O/N孵育),两种底物蛋白也用另一种市售的去糖基化产物处理,并显示数据以供比较。另一方面,N-聚糖在内质网中翻译地连接到未折叠的蛋白质上。这导致某些 N-糖基化位点难以被 Genovis的PNGase F 接近,或者一旦底物蛋白折叠成其天然状态,就根本无法接近。因此,这种N-聚糖的水解需要底物蛋白以与酶活性相容的方式变性。山东瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

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