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云南N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

关键词: 云南N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究 PNGaseF去糖基化酶

2024.07.04

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水解O-聚糖的酶不会从变性中获益,这就是为什么OmniGLYZOR色谱柱只能在天然条件下使用的原因。 OmniGLYZOR 试剂盒 Microspin 以含有足够材料的试剂盒形式提供,可使5 × 50-100 μg 或 10 × 50-100 μg 糖蛋白去糖酸化。N-和O-连接聚糖的快速高效;与LC-MS兼容;完全去除聚糖,改进基础蛋白的分析;固定形式可提高酶与底物的比率,从而实现快速去糖基化。 IgdE酶(FabALACTICA®)和PNGaseF酶分别购自Genovis(马萨诸塞州,美国)。用于水解糖蛋白上N-聚糖的冻干酶。Genovis的PNGase F 冻干剂以冻干粉的形式提供,装在 1000 或 5 x 1000 单位小瓶中,分别用于消化 1 mg 或 5 x 1 mg 糖蛋白。用SialEXO处理血清,上样于GlycOCATCH,洗涤,洗脱O-糖基化蛋白。Swiss Prot 数据库鉴定蛋白质列表。云南N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

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GlycOCATCH®亲和纯化:用于粘蛋白型O-糖蛋白和肽亲和纯化的富集树脂。GlycOCATCH亲和纯化以方便的离心柱形式提供。该产品包含:4 个 GlycOCATCH 亲和纯化微离心柱,每个柱能够结合 50 μg 粘蛋白型 O-糖蛋白(总共 200 μg)。Genovis的SialEXO 冻干 200 单位,用于去除唾液酸;OpeRATOR 冻干 200 单位,用于结合的 O-糖蛋白的可选洗脱方法。1. 靶向 O-糖蛋白富集;2. 复杂样品的特异性净化;3. 用于改进 MS 分析的样品制备。O-糖基化蛋白和肽的特异性富集:O-连接聚糖参与多种生物过程,包括抑制病原体引起的gan染、炎症反应、造血和细胞信号传导。黑龙江固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶瑞典Genovis从而实现 O-糖谱分析、位点占用测定和 O-糖肽图谱以及使用 LC-MS 分析的中级方法。

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我们测量了FucosEXO从一组dai表不同键的不同寡糖底物中释放的岩藻糖。FucosEXO可有效释放α1-2、α1-3和α1-4连接的岩藻糖,对α1-6连接的岩藻糖残基没有活Genovis的FucosEXO的底物特异性:岩藻糖以不同的键存在于N-和O-聚糖上。α1-2、α1-3 和 α1-4 连接的岩藻糖常见于 O-聚糖中,并作为 N-聚糖的天线岩藻糖基化,而 α1-6 连接的岩藻糖被发现是 N-聚糖he心的修饰。β1-3,4半乳糖的水解:Genovis的GalactEXO 是一种β-半乳糖苷酶混合物,可水解 N-和 O-糖基化蛋白中的 β1-3,4-连接末端半乳糖。

用于离心柱中糖蛋白去胶基化的固定化酶。Genovis的FucosEXO固定化离心柱含有与琼脂糖珠共价偶联的FucosEXO酶,用于糖蛋白的去氟糖基化,而不会用酶污染z终制剂。Microspin 色谱柱可用于 5 或 10 x 0.5 mg 糖蛋白的去胶基化。1. 易于使用的离心柱;2. 提高酶与底物的比例,提高消化效率;3. z终样品中不含酶。有效去除α1-2,3,4连接岩藻糖:分析用复杂聚糖结构修饰的糖蛋白可能具有挑战性,需要高效和特异性的酶学工具。Genovis的FucosEXO 是 α-岩藻糖苷酶的混合物,用于有效水解 N-和 O-糖蛋白或寡糖上的 α1-2、α1-3 和 α1-4 连接的岩藻糖残基,无需辅助因子或添加现O-糖基化药有Tn抗原,定量he心 GalNAc 水平,减少了异质性。

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FucosEXO中的酶在大肠杆菌中表达,带有His标签,分子量为87 kDa和64 kDa。FucosEXO在天然条件下水解糖蛋白上的岩藻糖,在6至8的pH值范围内显示出高活性,无需辅助因子或添加剂。1. 用于方法开发的灵活格式;2. 可以结合酶以提高效率;3. 适用于自动化工作流程;4.即用型 - 只需加水即可。Genovis的FucosEXO 是 α-岩藻糖苷酶的混合物,用于在 N-和 O-糖基化蛋白或游离寡糖上有效水解 α1-2、α1-3 和 α1-4-连接的岩藻糖。人血清中 O-糖蛋白的富集:GlycOCATCH还可用于从复杂的样品混合物(如人血清)中选择性富集O-糖基化蛋白。简而言之,用Genovis的SialEXO处理血清并应用于GlycOCATCH树脂。洗涤树脂,用8M尿素洗脱O-糖基化蛋白。用胰蛋白酶消化样品并使用 RP-LC-MS/MS 进行分析,并使用 Swiss Prot 数据库鉴定蛋白质列表。O-糖基化蛋白以黄色表示。对游离的N-聚糖的分析表明,SialEXO在溶液中完全脱唾液酸化。湖北固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

用于糖蛋白去唾液酸化的冻干酶混合物SialEXO 冻干剂以冻干粉的形式提供,装在 2000 个单位的小瓶中。云南N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

使用Genovis的OpeRATOR图谱O-聚糖位点对依那西普进行LC-MS分析:依那西普是一种 Fc 融合蛋白,具有高度 O-糖基化的铰链区域。将依那西普与OpeRAT一起孵育,并使用LC-MS/MS分析所得糖肽。促红xibao生成素 (EPO) 是一种具有单个 O-糖基化位点的 ~30 kDa 糖蛋白。在PNGase F去除N-糖并使用SialEXO进行去唾液酸化后,用OpeRAT消化天然蛋白,并通过反相LC-MS分析所得蛋白质片段。O-糖基化的位点可以通过识别OeRATOR消化位点直接推断出来。为了获得良好性能,需要去除唾液酸助剂,因此购买中包括2000个单位(如果SialEXO冻干)。1. 用于方法开发的灵活产品形式;2. 可以结合酶以提高效率;3. 适用于自动化工作流程;4. 即用型 - 只需加水即可。O-聚糖是OpeRATOR活性所必需的,而该酶在N-聚糖上没有活性。OpeRATOR和SialEXO处理后,O-糖基化蛋白被消化成携带O-聚糖的肽。消化发生在O-糖基化位点的N端。云南N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

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