首页 > 医药健康 > 杭州RIP免疫沉淀磁珠原理

杭州RIP免疫沉淀磁珠原理

关键词：杭州RIP免疫沉淀磁珠原理免疫沉淀

2024.06.26

文章来源：

免疫沉淀技术RIP（RNA Immunoprecipitation，RNA免疫沉淀）是一种用于研究细胞内RNA与蛋白质相互作用的技术。RIP技术可以帮助我们了解转录后调控网络的动态过程，并发现miRNA等非编码RNA的调节靶点。

RIP技术的原理是利用针对特定RNA结合蛋白的抗体，将细胞内的RNA-蛋白质复合物沉淀下来。然后，可以通过分离纯化，对这些复合物中的RNA进行检测，如qPCR验证或测序分析。

表观遗传学和RNA生物学领域对不同RNA作用和功能的关注增加。RNA-蛋白质相互作用能够调控mRNA和非编码RNA的功能。对RNA潜能的这一新认识带动了新方法的发展，使研究人员能够定位 RNA-蛋白质相互作用。

免疫沉淀技术RIP的优缺点是什么？杭州RIP免疫沉淀磁珠原理

ChIP（染色质免疫沉淀）实验是一种用于研究蛋白质与DNA相互作用的技术。以下是ChIP实验的实验设计概述：

1. 目标蛋白的选择：确定您想要研究的目标蛋白，例如特定的转录因子或组蛋白修饰。

2. 样本的准备：根据研究的需要选择合适的细胞或组织样本。

3. 抗体的选择：选择具有高特异性和亲和力的抗体，这对于实验的成功至关重要。

4. 交联：使用甲醛等交联剂将蛋白质与DNA在体内共价结合，形成稳定的蛋白质-DNA复合物。

5. 细胞裂解：裂解细胞以释放染色质，同时保持蛋白质-DNA复合物的完整性。

6. 染色质的剪切：通过超声或酶消化将染色质剪切成适当大小的片段，通常在200-1000 bp之间。

7. 免疫沉淀：使用特定抗体与目标蛋白结合，然后利用蛋白A/G磁珠沉淀复合物。

8. 洗涤和洗脱：洗涤沉淀物以去除未特异性结合的蛋白质和DNA，然后洗脱目标蛋白-DNA复合物。

9. 逆转交联：使用蛋白酶K处理样品以逆转交联，释放DNA。

10. DNA的纯化和分析：纯化DNA并使用qPCR、芯片或测序技术（如ChIP-seq）进行分析。

温州Co IP免疫沉淀磁珠应用免疫沉淀技术ChIP是什么？

真核生物的基因组 DNA 以染色质（Chromatin）的形式存在。因此，研究蛋白质与 DNA 在染色质环境中的相互作用是阐明真核生物基因表达机制的基本途径，而染色质免疫共沉淀（Chromatinimmunoprecipitation，ChIP）技术是目前公认的研究此相互作用的选择，是真核生物基因表达机制研究中不可或缺的技术之一。

它的基本原理是在活细胞状态下，固定蛋白质-DNA（染色质）复合物，并将其切断为一定长度范围内的染色质小片段，然后通过免疫学方法（抗体亲和）沉淀此复合体，特异性地富集目的蛋白结合的 DNA，通过对目的片段的纯化与后期检测，从而获得蛋白质与 DNA 相互作用的信息。

免疫沉淀纯化所得抗原纯度低一般有多种原因：

1. 非特异性蛋白污染

如果洗脱所得抗原纯度较低，则有几种方法可以进行优化。在结合或洗涤缓冲液中加入去污剂或其他可以降低非特异性结合的组分。使用普通微珠预纯化样本还可以降低非目标分子的共纯化。此外，还可以使用无关蛋白 (如BSA) 封闭微珠。

2. 抗体污染

使用蛋白A、G或A/G的经典免疫沉淀实验中会出现抗体与抗原共洗脱的情况。如果共洗脱会影响下游分析，则需要使用抗体通过共价连接固定至微珠的方法进行实验，如Pierce 直接 IP 或交联 IP 的形式。

免疫沉淀IP技术选琼脂糖珠还是磁珠？

免疫沉淀实验步骤：

1. 样品制备

a. 悬浮细胞样品处理：离心收集细胞（4℃, 1000g, 5 min），用手指把细胞用力弹散。按照6孔板每孔细胞加入150-250 μL裂解液的比例加入含蛋白酶抑制剂的裂解液（裂解液应在使用前数分钟内加入蛋白酶抑制剂Cocktail，使蛋白酶抑制剂Cocktail的终浓度为1×）。混匀后置于冰上处理10 min；离心收集上清液（4℃, 14000g, 10 min），置于冰上备用（或置于-20℃长期保存）。

b. 贴壁细胞样品处理：移去培养基，用PBS清洗细胞两遍；用细胞刮棒刮脱细胞，收集至1.5mL EP管内，按照6孔板每孔加入150-250 μL裂解液的比例加入含蛋白酶抑制剂的裂解液（裂解液应在使用前数分钟内加入蛋白酶抑制剂Cocktail，使蛋白酶抑制剂Cocktail的终浓度为1×）。吹打数下，使裂解液和细胞充分接触。混匀后置于冰上处理10 min；离心收集上清液（4℃, 14000g, 10 min），置于冰上备用（或置于-20℃长期保存）。

4. 后续：磁珠预处理——抗体吸附——抗原结合反应——抗体洗脱

免疫沉淀纯化所得抗原纯度低是什么原因？杭州anti Flag免疫沉淀外包公司

免疫沉淀技术ChIP的实验设计。杭州RIP免疫沉淀磁珠原理

免疫沉淀实验中抗体的选择非常关键，因为抗体的特异性和亲和力直接影响到实验的成功与否。

1. 特异性：抗体应当对目标蛋白具有高度的特异性，以避免与其他蛋白发生非特异性结合，导致假阳性结果。

2. 亲和力：抗体对目标蛋白的亲和力要足够高，以确保在免疫沉淀过程中能够有效地捕获目标蛋白。

3. 抗体类型：单克隆抗体提供更高的特异性和批间一致性，而多克隆抗体可能提供更强的结合能力和更广的表位覆盖。

4. 应用验证：选择已经过验证的抗体，这增加了实验成功的可能性。

5. 供应商信息：选择信誉良好的抗体供应商，并查看供应商提供的技术数据和客户评价，以帮助做出决策。

杭州RIP免疫沉淀磁珠原理

点击查看全文